يقوم مكتب المشاريع البحثية بمعهد المخطوطات وإحياء التراث الإسلامي بالأعمال الآتية:
1. الإشراف على المشاريع البحثية المقدمة لمركز إحياء التراث الإسلامي، ومتابعتها.
2. تبني الموقع الإلكتروني للمعهد وتفعيله.
3. إقامة وتنسيق الدورات التدريبية المتعلقة بالمخطوطات، وذلك بالتعاون مع معهد البحوث والدراسات الاستشارية.
4. تقديم الدعم الفني لأقسام المعهد.