طبقاً للمادة التاسعة من اللائحة الموحدة للبحث العلمي في الجامعات، يتم تشكيل مجلس المركز على النحو التالي:

• مدير المركز، وله رئاسة المجلس.
• خمسة من أعضاء هيئة التدريس السعوديين المتميزين في مجال تحقيق التراث الإسلامي.

ويتولى مجلس المركز النظر في جميع الأمور المتعلقة بالمركز، وذلك طبقاً للمادة العاشرة من اللائحة الموحدة للبحث العلمي في الجامعات.

وقد صدر قرار معالي رئيس الجامعة رقم (400204569) وتاريخ 12/04/1440هـ بتشكيل مجلس مركز إحياء التراث الإسلامي لمدة عامين، على النحو التالي:

يختص مجلس المركز: 

1. اقتراح مشاريع البحوث، ورفعها إلى مجلس معهد المخطوطات وإحياء التراث الإسلامي.
2. النظر في البحوث التي تحال إلى المركز، والتوصية بشأنها.
3. اقتراح لجان العمل في البحوث.
4. اقتراح لجان تحكيم البحوث، والمشاريع العلمية.
5. التوصية بعقد الندوات، والمحاضرات العلمية.