تقوم جامعة أم القرى، ممثلة بمعهد المخطوطات وإحياء التراث الإسلامي منذ إنشائه، بخدمة المخطوطات جمعاً وفهرسة وتحقيقًا. ومواصلة لهذا المنهج وذلك الدور البارز فإن المعهد يهدف إلى ما يلي:

أولاً: جمع التراث الإسلامي بأصوله ومصوراته من داخل المملكة وخارجها.

ثانياً: العناية بالمخطوطات وفهرستها وتحقيقها وتسهيل وصولها للباحثين.

ثالثاً: تحقيق المخطوطات الإسلامية في شتى فروع المعرفة (وخاصة ما يخدم الأولويات البحثية للجامعة).

رابعاً: نشر وعرض الإنتاج الفكري المحقق في مجال التراث الإسلامي والحفاظ عليه. 

خامساً: التأهيل في مجال تحقيق المخطوطات والعناية بها.

سادساً: التعاون مع الجهات المشابهة في الداخل والخارج وتبادل المخطوطات والخبرات.

سابعاً: تقديم الاستشارات العلمية المتخصصة في مجال المخطوطات جمعاً وفهرسة وتحقيقاً.