تشرف وكالة الكلية للشؤون التعليمية على تنفيذ المهام الآتية:

• تطوير المنهج الدراسي للكلية للتوافق مع الأهداف والاستراتيجيات المقرة والمستهدفة.
• متابعة تنفيذ البرامج والمقررات الدراسية كما هو مرسوم في مخطط المنهج وضمان جودتها.
• رصد ومتابعة أداء وتحصيل الطلاب وسلامة تطبيق وسائل التقييم الموضوعية والعادلة لقياس التحصيل العلمي والأداء.
• تقديم الدعم والإرشاد الأكاديمي والمساندة للطلاب، وتمكينهم من الاستفادة القصوى من فرص التعليم والتعلم.
• إعداد الجداول الدراسية وجداول الاختبارات ومتابعة تنفيذها.
• متابعة تحقيق الجودة الأكاديمية في كافة جوانب العملية التعليمية.
• تنظيم الأنشطة التي تنمي مهارات أعضاء هيئة التدريس بما يخدم البرنامج الأكاديمي. 
• تكثف الوكالة أنشطتها للوصول إلى هذه الأهداف من خلال الأذرع الآتية: مركز التعليم الطبي وبحوثه، والمكتب الأكاديمي، مكتب الإرشاد الأكاديمي، ولجنة المناهج، ووحدة الجودة.