أنشئت وحدة المتاحف بقرار من معالي مدير الجامعة رقم 776/2، وتاريخ 09/02/1420هـ، بناءً على توصيه تقدم بها بعض الأساتذة الأكاديميين في الجامعة الذين لهم خلفية بشؤون المتاحف، بغرض إعادة هيكلة العمل، والعرض في المتاحف المتخصصة في الجامعة من خلال تجميعها في مكان واحد لتكون نواة لمتحف علمي شامل يخدم ويساهم في تحقيق العديد من الأهداف.
هذا وقد ضمت إدارة المتاحف التي تم اختيار أعضائها من بعض الأساتذة المتخصصين أهم التخصصات في علم المتاحف، واستطاعت تكوين أرضيةً مناسبةً تمكنت من تحقيق الكثير من الإنجازات التي تتوافق مع الدعمين المعنوي والمالي الذي تتلقاهما إدارة المتاحف من معالي مدير الجامعة، ومن إدارات الجامعة المختلفة.

الرسالة:

خدمة مكة المكرمة وجامعة أم القرى والعلم والمعرفة والإنسان والمقيم والحاج والزائر، والتعريف بالفنون والحضارة المكية، والإسهام الجامعي في خدمة التراث الإنساني ليكون منارة يؤمها قاصدي المسجد الحرام من كل فج عميق.

الأهداف:

• خدمة طلاب الجامعة في مقرراتهم الدراسية وبحوثهم العلمية؛ وذلك بما يتوفر لدى المتحف من مقتنيات متنوعة سواء كانت تراثية قديمة أو محنطات حيوانية أو صخور ومعادن، مع الاهتمام بالعديد من الرموز التراثية التي تتعلق أساساً بالبيئة وبالتراث المكي.
• نشر الثقافة المتحفية في أوساط المجتمع الجامعي وأهالي مكة المكرمة، وبناء الإنسان والمكان ليكون منارة للعلم والمعرفة يؤمه قاصدي المسجد الحرام من كل فج عميق.