تأسس قسم العلاج الطبيعي (قسم علوم التأهيل الطبي حاليا) في عام  ١٤٢٦هـ كأحد أقسام كلية العلوم الطبية التطبيقية ليقدم برنامج بكالوريوس العلاج الطبيعي ومدته خمس سنوات منها أربع سنوات دراسية وسنة تدريب ميداني (سنة الامتياز). في عام ١٤٤١هـ تم افتتاح برنامج ماجستير العلاج الطبيعي والذي يضم ثمانية مسارات (الطب الرياضي- الأطفال- العظام- الأعصاب- القلب الرئوي- صحة المرأة - الجراحة والأورام- الفسيولوجيا الكهربائية السريرية).