تماشياً مع رؤية الكلية، يسعى قسم التشريح إلى أن يكون مركزاً متميزاً في علم التشريح الإكلينيكي، في مجال التعليم والبحث العلمي وخدمة المجتمع.
إن رسالة القسم هي امتداد لرسالة الكلية في تخريج أطباء أكفاء يقدمون خدمات طبية عالية الجودة، مؤهلين لإكمال تخصصاتهم الطبية في الداخل والخارج، وكذلك تدريبهم للقيام بالأبحاث العلمية للمساهمة في خدمة المجتمع ومسيرة التقدم العلمي والطبي واللحاق بالمستويات المتميزة والعالمية.