بفضل من الله تعالى يقدم قسم الكتاب والسنة أربعة برامج للدراسات العليا، ويمنح الدارسين والدارسات الشهادات العليا  فيها، على النحو التالي :

1) برنامج درجة الماجستير:

ويضم تخصصين هما: التفسير وعلوم القرآن، والحديث وعلومه.

2) برنامج درجة الدكتوراه:

ويضم تخصصين هما: التفسير وعلوم القرآن، والحديث وعلومه.

ويقوم بالتدريس والإشراف نخبة من أعضاء هيئة التدريس بالقسم