تم إنشاء كلية الصيدلة وقسم الصيدلة الإكلينيكية عام ١٤٢٧/ ١٤٢٨هـ. ويعتبر القسم أحد الأقسام العلمية الخمسة للكلية، حيث يهدف القسم إلى تخريج جيل جديد من الصيادلة الأكفاء ممن يمتلكون مهارات خاصة في الرعاية الصيدلانية، بهدف الحصول على مستوى أفضل من الخدمات الصحية؛ وهذا يكون عن طريق تزويد طالب كلية الصيدلة بمعلومات قيّمة عن علم العلاجيات والأدوية واقتصاديات الدواء والصيدلة الوبائية لضمان سلامة المرضى.
وللحصول على هذا المستوى العالي من الخدمات الصحية، يهتم القسم بالجوانب النظرية والعملية للصيدلة السريرية داخل الجامعة، أو في المستشفيات التعليمية المنتشرة في المنطقة، وذلك بهدف تحسين مهارات الطلاب السريرية، ويتم ذلك تحت إشراف نخبة من الاستشاريين المؤهلين تأهيلاً عالياً.