أنشئت وكالة الجامعة للشئون التعليمية بناءً على موافقة خادم الحرمين الشريفين الملك عبدالله بن عبدالعزيز -رحمه الله- بالتوجيه البرقي الكريم رقم 4465/ م . ب، وتاريخ 1431/5/28هـ، حيث تعتبر وكالة الجامعة للشؤون التعليمية في جامعة أم القرى من الوكالات حديثة النشأة.

وقد كان الهدف من إنشائها هو المساهمة في  تطوير التكوين المهاري والمهني والأخلاقي لطلاب الجامعة والاهتمام والارتقاء به من جميع النواحي، بالإضافة إلى تذليل كل ما يعترض العملية الأكاديمية من عقبات، وتوفير جميع الإمكانيات والفرص التعليمية لأبنائنا الطلبة.