تأسست وكالة الجامعة للشؤون التعليمية بموجب موافقة المقام السامي وفق التوجيه البرقي رقم (٤٤٦١٥م.ب) بتاريخ ٢٨/٥/١٤٣١هـ، وفي عام ١٤٤٤هـ، وافق مجلس جامعة أم القرى على تغيير مسمى الوكالة إلى وكالة الجامعة للشؤون الأكاديمية، تزامنًا مع تحديث الهيكل الإداري للجامعة.
تسعى وكالة الجامعة للشؤون الأكاديمية، بالتعاون مع كليات الجامعة وعماداتها المساندة، إلى الارتقاء بالتجربة التعليمية الشاملة في الجامعة، وتعزيز جودة رحلة الطالب الأكاديمية. كما تركز على تهيئة بيئة تعليمية محفزة على الإبداع، داعمة للتحول الرقمي، ومواكبة لمتطلبات الاستدامة. وتولي الوكالة اهتمامًا بتحديث البرامج الأكاديمية القائمة، واستحداث برامج جديدة تلائم تطلعات المستقبل، إلى جانب استقطاب نخبة من أعضاء هيئة التدريس ذوي الكفاءة العالية لتلبية احتياجات البرامج الأكاديمية المتنوعة.
كما تولي وكالة الجامعة للشؤون الأكاديمية اهتمامًا كبيرًا باستقطاب الكفاءات الأكاديمية المتميزة من الكادر التعليمي والفني، بما يسهم في دعم جودة وتنوع البرامج الأكاديمية.