الأدوية الطبيعية هي أقدم وأول مصدر اعتمدت عليه مزاولة الصيدلة في الأزمنة القديمة. اشتقت كلمة "فارماكوجنوسي" (علم العقاقير) من اللفظ اليوناني "فارماكون" بمعنى عقار واللفظ "جنوسيس" بمعنى معرفة.

 يُعنى قسم العقاقير بدراسة المنتجات الطبية الطبيعية المشتقة من نبات أو حيوان أو كائنات بحرية. وتمثل النباتات الطبية أهم طائفة في مكونات المنتجات الطبيعية، ولهذا يركز القسم على تدريس طرق زراعتها وجمعها وتخزينها بجانب تصنيفها والتعرف عليها سواء كانت في صورتها الكلية أو في صورة مسحوق.  

يتناول قسم العقاقير دراسة المكونات النشطة للنباتات من حيث عزلها في صورتها الخالصة، وتركيبها الكيميائي، واستعمالاتها الطبية. ويغطي القسم أيضاً دراسة الأنظمة المختلفة لطب الأعشاب والطب البديل بالإضافة إلى آليات التكنولوجيا البيولوجية الحديثة لإنتاج العقاقير، مثل زراعة الأنسجة، الهندسة الوراثية، والتحول البيولوجي.

 ويركز الباحثون من أعضاء هيئة التدريس على النباتات الطبية وخاصة التي تنمو في المملكة بغرض اكتشاف مكوناتها النشطة التي قد تساعد في علاج الأمراض المختلفة.