أُنشئت الإدارة بموجب قرار معالي وزير المالية والاقتصاد الوطني رقم (21/4201)، المؤرخ في 11/08/1403هـ؛ وهي وحدة مُراقبة إدارية ترتبط بسعادة وكيل الجامعة، وتهتم بمراقبة المخزون في المستودعات الرئيسية للجامعة وكلياتها التي تقع خارج المقر الرئيسي، وكذلك مراقبة العهد بجميع قطاعات الجامعة وفقاً للمادة (24) من قواعد وإجراءات المستودعات الحكومية، وذلك بقيامها بما يلي:
1 – مُتابعة حركة المخزون لضمان استمرار العمل المُستودعي بشكل مُنتظم.
2 – تحديد مُستويات المخزون لضمان استمرار العمل المُستودعي بشكل مُنتظم.
3 – مُمارسة أعمال الجرد لتسهيل مهام الرقابة الخارجية على المُستودعات من الأجهزة المُختلفة.
4 – اكتشاف الأخطاء في حينها ومُحاولة تلافيها مُستقبلاً.
5 – المُحافظة على مُمتلكات الدولة، وذلك بالحد من فقد الأصناف أو تلفها أو تقادمها.