يعتبر قسم الكيمياء بكلية العلوم التطبيقية بجامعة أم القرى من أقدم أقسام الكيمياء التي أنشئت على مستوى الجامعات السعودية، حيث أنشئ القسم بجانب أقسام الكليات المختلفة (الفيزياء- الرياضات- الأحياء) عام 1401 هجرية.

يمنح قسم الكيمياء درجة البكالوريوس لتخصصي الكيمياء البحتة والكيمياء الصناعية، لطلاب وطالبات القسم. 

يمتلك قسم الكيمياء مجموعات بحثية متميزة، تحسب ضمن مراكز البحث العالمية، حيث إنه يضم كوكبة من أعضاء هيئة التدريس والذين لهم العديد من الأبحاث المنشورة في العديد من المجلات والدوريات المحلية والدولية، فيما ترتبط تلك المجموعات البحثية بعلاقات شراكة متميزة مع العديد من الشركات والمصانع وأصحاب الأعمال على مستوى المملكة، حيث تقدم لهم المشورة العلمية المطلوبة لحل المشكلات التي تواجههم، وذلك يتواكب مع رؤية وأهداف قسم الكيمياء بكلية العلوم التطبيقية بجامعة أم القرى.

يقدم قسم الكيمياء برنامجين دراسيين؛ برنامج الكيمياء (40200)، وبرنامج الكيمياء الصناعية (40207)، يحصل الطالب من خلالها على درجة البكالوريوس في الكيمياء بعد إنهائه بنجاح دراسة (138) ساعة معتمدة، ويحصل على درجة البكالوريوس في الكيمياء الصناعية بعد إتمام دراسة (138) ساعة معتمدة بنجاح، علماً بأن الخطة الدراسية تمكّن الدارس من الربط بين ما يحصل عليه من معرفة نظرية والجانب التطبيقي لها، وذلك من خلال العدد الكبير من المساقات العملية المدرجة في الخطة والتي يدرسها الطالب في مختبرات الكلية المجهزة بأحدث التجهيزات وفق المعايير العالمية، الأمر الذي يجعله قادراً على التعامل مع المشاكل العملية ذات العلاقة بتخصصه، ويرفع من مستوى تأهيله ليكون متميزاً، سواءً في سوق العمل أو أثناء إكماله دراساته العليا.